پس از کنترل کیفیت، باید خوانشها به ژنوم مرجع همتراز شوند. ابزارهایی مثل HISAT2 یا STAR برای این کار استفاده میشوند. انتخاب پارامترهای درست مثل طول seed و تعداد mismatch مهم است. خروجی این مرحله فایل BAM است که مکان هر خوانش را در ژنوم نشان میدهد. ذخیره منظم خروجیها به جلوگیری از سردرگمی کمک میکند.
برای مشاهدهٔ ادامه، خرید کنید
دسترسی سریع و فوری